它竟然是风湿性关节炎的祸首
文章题目：ExpansionofintestinalPrevotellacopricorrelateswithenhancedsusceptibilitytoarthritis
中文题目：肠道普氏菌丰度增加会提高风湿性关节炎的患病风险
期刊题目：eLife发表时间：IF：9.
相关产品：细菌多样性测序、宏基因组测序
测序平台：平台样品来源：粪便
研究背景
风湿性关节炎（RA）是最常见的系统性自身免疫病；其特征是关节炎症。若不及时治疗，可导致关节畸形、残疾甚至死亡。动物模型表明：肠道菌群能在存在自身免疫的前提下触发炎症。前人研究发现：肠道菌群的变化与自身免疫疾病的发展有重要的关系；然而，两者间的因果关系还未明确阐明。为了研究肠道菌群在RA发展中所扮演的角色，作者利用16SrRNA高通量测序及宏基因组测序分析健康人与RA病人的粪便菌群组成差异。
实验设计
1.选取44个新发风湿性关节炎病人（NORA），26个慢性、接受治疗风湿性关节炎病人（CRA），16个银屑病性关节炎病人（PsA），28个健康对照（HLT）的粪便样品，共个样品；同时记录测试者年龄、疾病持续时间、疾病活性参数、自身抗体状况、用药情况等信息。
2.细菌多样性分析选择16SrRNAV1-V2引物，采用平台进行测序。各样本的数据抽平至条序列进行后续分析。
3.选取18个NORA病人及5个健康人的粪便样本，采用Illumina平台（PE）进行宏基因组测序；结合12个来源于HMP的样品数据进行分析。
主要研究结果：
1、普氏菌和NORA的关系
与健康人（HLT）相比，NORA肠道中的普氏菌（Prevotella）丰度升高；而毛螺菌（Lachnospiraceae)、拟杆菌（Bacteroides）和GroupXIVClostridia等维持肠道稳态的有益微生物丰度降低。这与已有报道类似，普氏菌和拟杆菌两者呈现出此消彼长的情况。
NORA、HLT、CRA、PsA个体中普氏菌/拟杆菌的比例变化
2、Prevotellacopri菌株具有多样性，具有临床诊断的可能性
HLT普氏菌有两个特定的ORF，编码泛醌氧化还原酶；同样，NORA普氏菌有两个特定ORF，与ATP磷酸转运蛋白编码有关。这些ORF可能做为区分健康或者疾病的分子标记。
3、健康人和NORA肠道微生物的代谢差异
选取了5个HLT和14个NORA样本，研究结果显示，NORA的纤维素和嘌呤代谢的酶减少，与半胱氨酸代谢相关的酶增多。
4、普氏菌可加剧结肠炎症
通过小鼠模型灌胃实验发现：与对照相比，接种普氏菌小鼠的肠道普氏菌丰度显著上升；体重降低；内镜检查情况较差；上皮细胞受损严重。
A：HLT和NORA小鼠样本中普氏菌的丰度比较（QPCR）；B：HLT和NORA小鼠样本中普氏菌的丰度比较（16S多样性测序）；C：HLT和NORA小鼠体重的变化；D：HLT和NORA小鼠内镜检测；E和F分别为病理学和组织学观察结果。
主要结论：
1、与健康人相比，NORA病人普氏菌（Prevotellacopri）的丰度更高。
2、确定肠道普氏菌在RA发病机理中的潜在作用。
3、鼠模型验证结果显示：与对照相比，移植普氏菌小鼠的疾病状况更严重。
参考文献：
ScherJU,SczesnakA,LongmanRS,etal.ExpansionofintestinalPrevotellacopricorrelateswithenhancedsusceptibilitytoarthritis[J].Elife,,2:e.
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